唯那生物-线粒体基因组数据上传(原始数据... ¥2000.00
唯那生物-线粒体基因组完成图测序与分析(... ¥4000.00
唯那生物-叶绿体基因数据上传(原始数据) ¥2000.00
唯那生物-叶绿体基因组完成图测序与分析(... ¥4800.00
唯那生物-转录组数据上传(原始数据) ¥1000.00
唯那生物-真菌转录组测序与分析 ¥1200.00
唯那生物-原核转录组测序与分析 ¥1700.00
唯那生物-宏基因组数据上传(原始数据) ¥1000.00
唯那生物-噬菌体基因组数据上传(原始数据... ¥1300.00
唯那生物-噬菌体基因组数据上传(组装结果... ¥1500.00
我们可以提供:
1、叶绿体、(动物)线粒体从组织样本抽提、基因组测序到数据分析的全套服务;
2、承接纯数据分析的个性化数据挖掘项目;
3、服务到文章发表,售后更有保障;
4、优质项目可以通过文章合作的方式,享受更优惠的价格。
一般情况下,二代高通量测序的数据即可有效组装植物叶绿体、动物线粒体基因组至成环的标准,如果特殊样本不易成环,可以首先借助PCR方法辅助成环。对于有特殊要求的客户,可以采用三代+二代测序的方式。
基础分析 | 高级分析 | 个性化分析 |
数据质控与统计 | 基因组圈图绘制 | 基因组和CDS碱基组成分析 |
基因组组装 | gbk文件生成 | 密码子使用偏好性分析 |
基因预测 | SSR分析 | |
Nr注释 | IR区扩张收缩分析 | |
代谢通路注释与分析 | 共线性比较分析 | |
COG注释 | SNP/InDel分析 | |
rRNA、tRNA预测 | 进化树构建分析 | |
比较基因组圈图绘制 | ||
数据上传NCBI |
送样建议
送来可以有四种形式,即组织、总DNA、提纯的叶绿体/线粒体DNA和PCR扩增产物。不同样品形式送样要求不同,具体要求如下。
送样标准(Illumina测序) | |
送样形式 | 送样标准(PE文库) |
提纯的cpDNA | 浓度:20ng/μl 总量:1 μg(单次建库) DNA主条带明显,且基因组片段分布在2kb以上 |
PCR产物 | 若PCR产物不需要打断,直接建库测序 浓度 10ng/μl 总量 1μg(单次建库)
若PCR产物需打断成400bp片段建库测序 浓度:20ng/μl 总量:2μg(单次建库) |
组织样本 | 新鲜组织:≥2g |
提取的组织DNA | 浓度:20ng/μl 总量:1 μg(单次建库) DNA主条带明显,且基因组片段分布在2kb以上 |
DNA样品送样细节
1、若样品是提纯的叶绿体/线粒体DNA或组织总DNA,推荐使用高质量的商业化DNA提取试剂盒制备样品,严格按照实验protocol,要求DNA样品的OD260/280=1.8-2.0,OD260/230=1.8-2.2,一般地,PE文库构建要求DNA的主峰带明显且片段在2 kb以上,PacBio文库要求DNA的主峰带明显且在23 kb以上;
2、对DNA形式的样品确保用Rnase A处理,不存在RNA污染;
3、对送样形式为提纯的叶绿体/线粒体DNA或组织总DNA的,最好先通过琼脂糖电泳检测,凝胶浓度0.8%,最好使用新制的宽孔凝胶,在新鲜的电泳液中以90 V总电压(约5 V/cm)电泳1小时左右,染色拍照,采用λ DNA/HindIII等较大的DNA Ladder作为marker;
5、样品可以干粉寄送,或者溶于无水乙醇、灭菌TE Buffer或者灭菌去离子水中,要避免反复冻融,干粉或者溶于无水乙醇的可以常温寄送,溶于水溶液的则需干冰或者冰袋运输并选择较快的运输方式;
6、溶解剂中不能含有不溶解的物质存在,不能有明显的色素污染,不能含有螯合剂(如EDTA)、二价金属离子(如Mg2+、Ca2+)、变性剂(如胍盐、苯酚)、去污剂(如SDS)等;
7、所有样品必须保存在1.5 mL的灭菌离心管中,并在管盖和管壁上做好标记,用封口膜封好管口,仔细填写《样品信息单》,核对保证管壁上的标注与《样品信息单》上的描述一致无误后直接邮寄给我方。